本港台开奖现场直播 j2开奖直播报码现场
当前位置: 新闻频道 > IT新闻 >

wzatv:【图】人和未来刷新世界纪录,助力生物信息云计算

时间:2016-11-07 23:46来源:香港现场开奖 作者:118KJ 点击:
科技特讯11月7日讯:2 016年11月4日,基因组云计算技术开发者大会(GCTA)在第11届国际基因组学大会(ICG)上正式公布了历时6个月的全球公开竞赛结果。 本届大赛由今年4月份成立的“

  科技特讯11月7日讯:2016年11月4日,基因组云计算技术开发者大会(GCTA)在第11届国际基因组学大会(ICG)上正式公布了历时6个月的全球公开竞赛结果。

  本届大赛由今年4月份成立的“中国生物信息云计算产业联盟”倡导发起,集聚华大基因、阿里云、英特尔、百度开放云、华为等单位的技术开发力量,通过汇聚BT和IT行业精英,共同解决基因组学数据大规模存储和计算等方面所面临的挑战。

  在众多BT和IT行业精英中,人和未来脱颖而出,成为本届大赛最大的黑马。人和未来CTO宋卓博士代表GTX团队领取了杯和证书。人和未来在数据压缩和计算加速两个项目上的成绩均刷新世界纪录,同时保持了最低的计算成本,将全基因组的计算分析带入百元(16$)时代。

wzatv:【图】人和未来刷新世界纪录,助力生物信息云计算

  此次大赛的竞赛项目分为以下2个:

  1、 数据存储问题:FASTQ数据的高倍数无损压缩

  将一个原始FASTQ格式的150GBDNA测序数据文件无损压缩至原来的1/15。

  2、 分析计算问题:高效的人类全基因数据分析

  30分钟完成55x人类全基因组数据标准分析。

  这两个选题瞄准的是生物信息云计算中最重要的两个问题——压缩和计算。只有高效的压缩才便于大规模向云端传输数据,降低云端存储成本;只有高效的计算才能充分体现云端弹性计算应有的优势。解决好这两个问题,就能站在技术制高点上,推动生物信息云计算行业的发展。

  双料王,人和未来的两项成绩均刷新世界纪录

  本次比赛项目的难度和要求都非常高,吸引了全球300多家机构和个人的参赛,诞生了令人惊喜的成绩,首届GCTA风云挑战赛完美收官。两项比赛第一名的最好成绩均由人和未来生物科技 (北京)有限公司获得,开奖,性能如下:

  1. 压缩存储:7个测序质量值下,压缩率达到1/18;33个测序质量值下,压缩率达到1/8。

  与行业默认标准gzip相比,计算时间为其1/6且压缩后文件大小为其1/4,即压缩效率是gzip性能的24倍。 在这样的极高倍率压缩技术的支持下, 使用百兆网络,就能达到以千兆速度上传

  数据的效果,直播, 使得大规模测序数据上云成为可能。 此外,若按照AWS云每gb云存储成本0.03美金/月计算。该高倍率压缩技术将能让每1000人的测序数据云存储,每月节省1.1万美金,大幅

  降低云存储成本。 该技术突破,作为一项重要的基础性工作,为整个行业的基因信息计算上云铺平了道路。

  2. 加速计算:18分钟完成400G 55x人类全基因组分析。

  不仅如此,人和未来在计算加速比赛的成绩也刷新了世界记录:400G(55x)全基因组数据分析,利用AWS上的300台机器,将分析时间从单台服务器的30个小时,缩短为18分钟,机时费

  用仅为$16,将全基因组计算带入百元时代。对比单台标准服务器,数据分析速度提高了90倍,可节约75%的云计算机时费用。

  基因测序技术日渐普及,基因检测的核心竞争力已经不仅限于测序产生数据的能力,大数据、高性能计算、机器学习这些IT领域里面的热词和标签会出现在越来越多的基因检测公司身上。BT与IT的结合,相信能实现技术创新,用科技的力量推动和加快精准医疗的发展,对全行业发展具有重大意义。

(责任编辑:本港台直播)
顶一下
(0)
0%
踩一下
(0)
0%
------分隔线----------------------------
栏目列表
推荐内容