核糖体释放分数评估了与核糖体结合的RNA片段沿整个 RNA 分子的分布情况。真正编码的 RNA 的 ORF 应该比终止密码子后的序列有更大比例的核糖体关联区域。（图片来源：BRYAN SATALINO）

　　使用了该标准的一项研究发现，绝大多数基因间的 lncRNAs 确实是不编码的，但有5%左右的 lncRNAs 的核糖体释放分数与编码蛋白的转录本类似。对于数以万计的 lncRNAs 来说，5%是一个庞大的数字，暗示着可能会有数量庞大的微肽存在。

　　为了证实 sORF 的翻译事件并明确其产生的微肽，基于核糖体足迹图谱、序列保守性、同义突变频率及其他特征的研究，研究者们研发出了新的度量标准和算法（比如：Fragment Length Organization Similarity Score （FLOSS），Phylogenetic Conservation Score of a sORF （PhyloCSF））。2015年11月研究者们建立了名为 sORFs.org 的 sORF 数据库，用于积累和搜集有关 sORFs 及其翻译能力的数据。

　　现在，数据库里有小鼠、果蝇和人类核糖体图谱分析研究所确定的全部 sORFs，目前存有高达266342个 sORFs，但各类筛选指标能将这个庞大的列表进一步缩小。经过严格筛选，来自人类的数据列表已降至约400个强候选 sORFs。同时，研究者们系统地开展了蛋白质质谱实验，用以明确算法得到的微肽是否真的在细胞中存在。

　　一旦确定了某个新的微肽，就要用分子生物学实验探索其功能。这个过程进展较慢。不过研究者们已经明确了几个新的微肽的功能。2016年1月，研究者报道了一个 lncRNA 编码的被称作 dwarf open reading frame（DWORF）的微肽，它是含有34个氨基酸的肌肉特异性微肽，在小鼠心脏中大量表达，能够调节肌肉收缩，但在缺血人体心脏组织中的表达被抑制，提示可能与心脏衰竭有关。另一项新发现是一类感染人类巨细胞的病毒 lncRNA编码的微肽，它能在以前感染过的患者中引起T细胞免疫应答，提示这类微肽很可能具有免疫原性，也说明了微肽在某些疾病发生过程中的重要性。

　　随着研究人员对基因组小片段进行更仔细地梳理，更多微肽的生物学功能将会被发现。如你所见，它们可能因短小的序列而被忽视，其 sORFs 也可能被埋在统计学噪声里，而翻译微肽的 RNA 也可能被错误归类，但这都并不妨碍它们扮演重要角色，行使着举足轻重的基本生物学功能。

　　参考文献

　　1.Ruth Williams, Noncoding RNAs Not So Noncoding. ?articles.view/articleNo/46150/title/Noncoding-RNAs-Not-So-Noncoding/

　　2. Ruth Williams, Finding Mislabeled Noncoding RNAs. ?articles.view/articleNo/46203/title/Finding-Mislabeled-Noncoding-RNAs/

　　3. M. Guttman et al., Ribosome profiling provides evidence that large noncoding RNAs do not encode proteins. Cell, 154:240-51, 2013.

　　4. Audrey M. Michel and Pavel V. Baranov. Ribosome pro?ling: a Hi-Def monitor for protein synthesis at the genome-wide scale. WIREs RNA, 4:473–490, 2013.

　　5. E. N. Olson et al., A peptide encoded by a tran annotated as long noncoding RNA enhances SERCA activity in muscle. Science, 351 (6270): 271, 2016.

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